Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms