Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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