Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIFKQ9BYG3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms