Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRBNQ96SW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms