Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms