Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms