Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG2BQ96BY7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms