Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms