Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms