Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms