Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3IL1Q8TBN0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms