Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF439Q8NDP4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF439Q8NDP4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF439Q8NDP4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF439Q8NDP4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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ZNF439Q8NDP4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF439Q8NDP4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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