Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms