Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms