Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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