Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DCAF6Q58WW2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DCAF6Q58WW2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms