Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms