Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms