Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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