Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms