Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NTRK3Q16288 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK3Q16288 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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