Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC85BQ15834 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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