Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NPTX1Q15818 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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NPTX1Q15818 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NPTX1Q15818 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPTX1Q15818 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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