Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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