Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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