Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NWD1Q149M9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NWD1Q149M9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NWD1Q149M9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NWD1Q149M9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NWD1Q149M9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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