Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms