Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RASGRF1Q13972 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526.4 ms