Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTCH1Q13635 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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