Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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