Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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