Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFEMP1Q12805 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms