Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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