Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms