Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP1-1Q07627 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP1-1Q07627 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms