Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms