Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABPAQ06546 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms