Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms