Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms