Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ1P61923 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ1P61923 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms