Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH15P55291 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH15P55291 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms