Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms