Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP1P29466 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms