Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms