Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2AP24928 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms