Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms