Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD2P13995 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms