Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHGAP10645 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHGAP10645 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms