Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms