Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms